These are the most commonly used Kanji. The order follows the ranking given by the KANJIDIC project.
day, sun, Japan, counter for days
Kunyomi: ひ, -び, -か
Onyomi: ニチ, ジツ
one, one radical (no.1)
Kunyomi: ひと-, ひと.つ
Onyomi: イチ, イツ
country
Kunyomi: くに
Onyomi: コク
meeting, meet, party, association, interview, join
Kunyomi: あ.う, あ.わせる, あつ.まる
Onyomi: カイ, エ
person
Kunyomi: ひと, -り, -と
Onyomi: ジン, ニン
year, counter for years
Kunyomi: とし
Onyomi: ネン
large, big
Kunyomi: おお-, おお.きい, -おお.いに
Onyomi: ダイ, タイ
ten
Kunyomi: とお, と, そ
Onyomi: ジュウ, ジッ, ジュッ
two, two radical (no. 7)
Kunyomi: ふた, ふた.つ, ふたたび
Onyomi: ニ, ジ
book, present, main, origin, true, real, counter for long cylindrical things
Kunyomi: もと
Onyomi: ホン
in, inside, middle, mean, center
Kunyomi: なか, うち, あた.る
Onyomi: チュウ
long, leader, superior, senior
Kunyomi: なが.い, おさ
Onyomi: チョウ
exit, leave, go out, come out, put out, protrude
Kunyomi: で.る, -で, だ.す, -だ.す, い.でる, い.だす
Onyomi: シュツ, スイ
three
Kunyomi: み, み.つ, みっ.つ
Onyomi: サン, ゾウ
same, agree, equal
Kunyomi: おな.じ
Onyomi: ドウ
time, hour
Kunyomi: とき, -どき
Onyomi: ジ
politics, government
Kunyomi: まつりごと, まん
Onyomi: セイ, ショウ
matter, thing, fact, business, reason, possibly
Kunyomi: こと, つか.う, つか.える
Onyomi: ジ, ズ
oneself
Kunyomi: みずか.ら, おの.ずから, おの.ずと
Onyomi: ジ, シ
going, journey, carry out, conduct, act, line, row, bank
Kunyomi: い.く, ゆ.く, -ゆ.き, -ゆき, -い.き, -いき, おこな.う, おこ.なう
Onyomi: コウ, ギョウ, アン
company, firm, office, association, shrine
Kunyomi: やしろ
Onyomi: シャ
see, hopes, chances, idea, opinion, look at, visible
Kunyomi: み.る, み.える, み.せる
Onyomi: ケン
month, moon
Kunyomi: つき
Onyomi: ゲツ, ガツ
part, minute of time, segment, share, degree, one's lot, duty, understand, know, rate, 1%, chances, shaku/100
Kunyomi: わ.ける, わ.け, わ.かれる, わ.かる, わ.かつ
Onyomi: ブン, フン, ブ
deliberation, consultation, debate, consideration
Kunyomi:
Onyomi: ギ
behind, back, later
Kunyomi: のち, うし.ろ, うしろ, あと, おく.れる
Onyomi: ゴ, コウ
in front, before
Kunyomi: まえ, -まえ
Onyomi: ゼン
people, nation, subjects
Kunyomi: たみ
Onyomi: ミン
life, genuine, birth
Kunyomi: い.きる, い.かす, い.ける, う.まれる, うま.れる, う.まれ, うまれ, う.む, お.う, は.える, は.やす, き, なま, なま-, な.る, な.す, む.す, -う
Onyomi: セイ, ショウ
take along, lead, join, connect, party, gang, clique
Kunyomi: つら.なる, つら.ねる, つ.れる, -づ.れ
Onyomi: レン